Il est largement réparti sur le bassin indo-pacifique. On le retrouve principalement en Mer de Banda et Mer d’Arafura entre l’Australie et les Philippines ainsi qu’aux Maldives. 

Le requin zèbre vit principalement sur les fonds sableux près du littoral où des récifs coralliens et va se déplacer en solitaire. Il se retrouve dans la partie tropicale de l’Indo-Pacifique, fréquentant les récifs de corail et biotope de sable à une profondeur approximative de 60 m. La forme de son corps un peu aplatit témoigne de son mode de vie.

Une expérience visant à prouver que les différents facteurs environnementaux étaient associés à la fidélité au site des requins zèbres à différents niveaux temporels et que ceux-ci peuvent être révélateurs des mécanismes à l’origine des mouvements a été réaliser. La photopériode et la température de l’eau étant susceptibles d’être importantes, les tendances intra-saisonnières sont plus susceptibles d’indiquer des réponses comportementales directes aux changements des conditions environnementales telles que l’augmentation de la hauteur des vagues, ainsi que la recherche de nourriture loin d’un refuge central puisque les requins zèbres font preuve de philopatrie comme les requins citrons (Negaprion brevirostris).